종자은행은 식물자원의 연구, 보존과 이용에 근간이 되는 종자의 장기 저장을 위해 필수적인 시설이다. 이 곳에는 종자의 장기 저장에 적합하도록 온도와 습도가 조절되는 첨단의 운영 체계를 갖추고 있다. 종자은행의 효율적인 운영을 위해 탐색, 수집, 분류, 보존 연구를 수행하는 연구실과 X-RAY 검사장치, 종자함수율 측정장치, 현미경 영상장치, 발아시험기 등을 갖춘 종자검사실 및 우량한 종자를 정선, 분리하기 위한 종자 정선기, 중력분리기, 훈증기, 건조기 등의 장치를 갖춘 종자처리실을 운영하고 있다.