종자은행은 식물자원의 연구, 보존과 이용에 근간이 되는 종자의 장기 저장을 위해 필수적인 시설이다. 이곳에는 종자의 장기 저장에 적합하도록 온도와 습도가 조절되는 첨단의 운영 체계를 갖추고 있다. 종자은행의 효율적인 운영을 위해 탐색, 수집, 분류, 보존 연구를 수행하는 연구실과 X-RAY 검사장치, 종자함수율 측정장치, 현미경 영상장치, 발아시험기 등을 갖춘 종자검사실 및 우량한 종자를 정선, 분리하기 위한 종자 정선기, 중력분리기, 훈증기, 건조기 등의 장치를 갖춘 종자처리실을 운영하고 있다.